Après l’obtention de son diplôme au Conservatoire de Cincinnati (USA) avec William McGraw en 2001, Jeffrey Thompson se voit décerner le premier prix au Concours International de Chant Baroque de Chimay (Belgique) présidé par William Christie où il retourne pour un concert en 2004 avec Jay Bernfeld (Fuoco e Cenere).
Il se produit par la suite à Boston avec la Haendel and Haydn Society dans Ariodante (Haendel) sous la direction de Christopher Hogwood avant d’y interpréter la partie soliste de La Messe en Si (Bach) et de se produire dans Le Retour d’Ulysse dans sa Patrie (Monteverdi) avec le Boston Baroque.
En 2002, Jeffrey Thompson est sélectionné pour participer à la première édition du Jardin des Voix avec Les Arts Florissants (William Christie) pour une tournée européenne avec un programme baroque. Parmi ces concerts figurent Acis and Galatea et Hercules (Haendel), des Motets d’Etienne Moulinié au Château de Versailles, le rôle de la Pythonisse dans David et Jonathas et la Messe des Morts (Charpentier) en tournée en Amérique du Sud, la doublure d’Abaris (Paul Agnew) dans Les Boréades et Les Indes Galantes (Rameau) à l’Opéra National de Paris. Il a également chanté la partie solo du motet In Convertendo de Rameau avec Les Arts Florissants (DVD édité par Opus Arte).
En 2004, Jeffrey Thompson interprète Zotico (Eliogabalo/Cavalli) sous la direction de René Jacobs au Théâtre de la Monnaie à Bruxelles et au Festival d’Innsbruck puis, en 2005, Atys (Les Paladins/Rameau) à Bâle. Il a également participé à une tournée avec Les Arts Florissants dans Les Paladins de Rameau avant de retourner au Théâtre de la Monnaie pour y chanter Monostatos (La Flûte Enchantée/Mozart) dans une production de William Kentridge et René Jacobs.
En 2006, il s’est produit dans The Fairy Queen (Purcell) en Espagne et La Passion Selon Saint-Matthieu (Bach) à Boston, et lors d’un concert Vivaldi avec Les Arts Florissants sous la direction de Paul Agnew. En 2007, il interprète le rôle de Ninus dans l’opéra Pirame et Thisbé (Rebel/Francoeur) à Nantes avec l’ensemble Stradivaria (Daniel Cuiller). En 2009, il a chanté lors de récitals de musique baroque anglaise avec les ensembles Ausonia (Frédérick Haas/Mira Glodeanu), Stradivaria et La Simphonie du Marais (Hugo Reyne). Et il a terminé l’année avec le Messie (Haendel) à Budapest avec le Purcell Choir/Orfeo Orchestra.
En 2010, on a pu l’entendre à L’Opéra Comique dans l’opéra Sancho Panza (Philidor) avec La Simphonie du Marais. Il s’est également produit à Budapest dans le rôle du Testo dans Il Combattimento (Monteverdi) et celui d'Hippolyte dans Hippolyte et Aricie (Rameau). Début 2011, il a chanté le rôle d’Aldobrandin dans l’opéra Le Magnifique (Grétry) à New York et à Washington avec Opera Lafayette (Ryan Brown).
Avec La Rêveuse (Benjamin Perrot & Florence Bolton), Jeffrey Thompson a enregistré deux oratorios et la cantate Leandro de Sébastien de Brossard, enregistrement sorti chez Mirare au printemps 2011.